Las 400 piezas que se exhiben en el MAP Cusco forman parte de la colección del Museo Larco de Lima, reconocida internacionalmente como una de las mejores del mundo. La curaduría estuvo a cargo de Fernando de Szyszlo y Cecilia Bákula, notables autoridades del mundo del arte y la historia del Perú.
El recorrido del MAP Cusco está compuesto por diez salas que exhiben piezas emblemáticas de las culturas precolombinas que florecieron en el Perú, así como los materiales que se usaron para su creación, elementos naturales que se tornan simbólicos en lo religioso, político y cultural.